福贡县隶属怒江傈僳族自治州，地处滇西北横断山脉中段碧罗雪山和高黎贡山之间的怒江峡谷，位于云南省怒江傈僳族自治州中部。东与兰坪白族普米族自治县和维西傈僳族自治县交界，南与泸水市相连，西与缅甸接壤，北与贡山独龙族怒族自治县相邻。边境线长142.218公里。

福贡县地处滇西北横断山脉中段碧罗雪山和高黎贡山之间的怒江峡谷。福贡县属高山峡谷地貌，地势北高南低，怒江由北向南纵贯全境，形成一个从北向南狭长的“V”字型谷地。县内最高点在碧罗雪山的嘎拉拍山峰，海拔4379米，最低点在与泸水市交界处的怒江江面，海拔1010米，相对高差达3369米。县城驻地上帕镇海拔1190.9米。